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1、Western blot檢測
免疫印跡（immunoblotting）又稱蛋白質印跡（Western blotting），它是根據抗原抗體的特異性結合檢測復雜樣品中的某種蛋白的方法。該法是凝膠電泳和固相免疫測定技術基礎上發展起來的一種新的免疫生化技術。由于免疫印跡常用于鑒定某種蛋白，并能對蛋白進行定性和半定量分析。
2、ChIP/ChIP-seq檢測
染色質免疫沉淀技術（ChIP）通過與染色質片段共沉淀和PCR技術，在體內檢測與特意蛋白質結合的DNA片段；ChIP-seq將ChIP和高通量測序技術結合，在全基因組范圍內檢測與特定因子或組蛋白結合的DNA位點。
3、CO-IP檢測
免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，CO-IP）可以測定兩種目標蛋白質是否在體內結合；確定一種特定蛋白質的新的作用搭檔；分離得到天然狀態的相互作用蛋白復合物。
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