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CRISPR/Cas12a（原稱 Cpf1）屬于 Class 2 Type V 型 CRISPR 系統，是細菌與古菌的適應性免疫機制，用于識別并切割入侵的病毒或質粒 DNA。與 Cas9 相比，其du特的工作模式使其在基因編輯、分子檢測及多基因調控中展現顯著優勢。
| 參數 | CRISPR/Cas12a | CRISPR/Cas9 |
|---|---|---|
| 蛋白大小 | 1,200-1,300 氨基酸（更小） | 1,000-1,600 氨基酸 |
| RNA 依賴 | 僅需 crRNA（無 tracrRNA） | 需 crRNA + tracrRNA 或嵌合 sgRNA |
| crRNA 加工 | 自主 RNase 活性（內置加工能力） | 依賴宿主 RNase III 和 tracrRNA |
| 切割末端類型 | 黏性末端（5' 突出） | 平末端 |
| PAM 識別序列 | 5'-TTTN/TTTV-3'（富含 T） | 5'-NGG-3'（富含 G） |
| 核酸酶結構域 | 單一 RuvC 結構域 | HNH + RuvC 雙結構域 |
| 反式切割活性 | 有（可非特異性切割 ssDNA） | 無 |
注：
V 表示 A/C/G（非 T），如 5'-TTTA/TTTC/TTTG-3'。
黏性末端 更易觸發同源重組修復（HDR），提升精準編輯效率。
多基因編輯高效性：
單一 crRNA 陣列可同時靶向多個基因，無需重復構建 tracrRNA，適用于復雜通路調控。
AT 富集基因組適配性：
對富含 AT 的基因組（如植物、寄生蟲）編輯效率顯著高于 Cas9。
低脫靶風險：
嚴格依賴 PAM 激活，且反式切割活性可關閉，全基因組脫靶率低于 Cas9。
遞送便捷性：
蛋白更小，更易包裝進 AAV 等病毒載體，適合體內基因治療。
| 應用方向 | 案例 | 優勢體現 |
|---|---|---|
| 多基因敲除 | 玉米中同步編輯 3 個抗旱基因，編輯效率 >60% | crRNA 陣列簡化設計 |
| 精準基因插入 | 利用黏性末端增強 HDR，實現人源 FIX 凝血yin子基因定點修復 | 高保真修復 |
| 分子診斷 | 結合反式切割活性開發 核酸檢測（CRISPR-DETECT） | 高靈敏度、無需 PCR 擴增 |
| 抗病毒研究 | 家蠶中編輯 BmNPV 病毒受體基因，抗病毒效率較 Cas9 提升 40% | 高效切割 AT 富集區 |
| 基因治療載體優化 | Cas12b（更小變體）脫靶率較 Cas9 降低 50%，適合臨床 | 高安全性遞送 |
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